上一季的結尾時科爾森已經出現在太空中，眼前正是支離破碎的地球。懸念足夠，于是新的一季登場，大家可謂是期待、等待已久。克里人、長生人、地球人三方劇集，從未來的末日到過去的混戰，穿越成為了新的主線。如何逆轉未來成為了神盾局特工的主要目標，而科爾森和他的團隊則是要面臨更危險的境遇和挑戰。 當然穿越回來之后眾人發現他們的敵人仍是九頭蛇，并且在重力鎓的配合下，某個人具有了毀滅地球的力量，如何掌控和消除，是眾人亟待處理的問題。