魔法禁書目錄 劇場版 恩底彌翁的奇跡是由錦織博 執導，阿部敦 井口裕香 三澤紗千香 日笠陽子 佐倉綾音 佐藤利奈 新井里美 豐崎愛生 伊藤加奈惠 谷山紀章 種田梨沙 潘惠美 瀨戶麻沙美 伊藤靜 勝杏里 古山貴實子 佐佐木望 岡本信彥 日高里菜 甲斐田裕子 川澄綾子 關俊彥 壽美菜子 戶松遙 南條愛乃 川原慶久 能登麻美子 藤村步 仲野裕 斧篤 島崎信長 村田太志 高森奈津美 大西沙織 石川界人 松岡禎丞 主演的一部動畫片。主要講述了：三年前太空飛船獵戶號墜毀學園都市，由此引發了嚴重的慘劇，而該事件也促成宇宙電梯恩底彌翁（Endymion）的建設。在恩底彌翁接近完工的前夕，上條當麻（阿部敦配音）和茵蒂克絲（井口裕香配音）揭示了熱愛歌三年前太空飛船獵戶號墜毀學園都市，由此引發了嚴重的慘劇，而該事件也促成宇宙電梯恩底彌翁（Endymion）的建設。在恩底彌翁接近完工的前夕，上條當麻（阿部敦配音）和茵蒂克絲（井口裕香配音）揭示了熱愛歌唱的少女鳴護亞麗莎。心懷夢想的亞麗莎經過不斷的修業和努力，終于得到了試鏡的機會，并有可能在恩底彌翁落成的慶祝活動中演唱。這一晚，當麻、茵蒂克絲和亞麗莎在夜歸途中遭到史提爾率領的魔法師們的攻擊。而學園都市秩序維持部隊的介入，無疑標志著魔法側和科學側全面戰爭即將爆發。亞麗莎的體內究竟隱藏著怎樣的力量和秘密……本片根據鐮池和馬（創作）、灰村清孝（插畫）的輕小說改編。